矿物质与其他营养素之间的关系错综复杂。十分微妙。在特定条件下既有协调关系又有制约关系,甚至还有拮抗关系。
许多微量元素之间既相互协调，又相互制约，血液内钙、镁、钾、钠等离子的浓度必须保持适当比例才能维持神经肌肉的正常兴奋性。如铁与锌,在一些被认为缺锌的情况下，缺铁很常见,需补充铁剂。在人体，以溶液形式同时提供铁和锌，铁会降低锌的摄取。然而可以肯定，这种相互作用只发生于以水溶液形式给予时，有食物存在时不会发生。当补充铁过多时,水溶液中锌的吸收可被明显抑制，但如加入饮食，则观察不到这一结果。同样，过多补充锌对铁吸收的抑制。锌铜铁元素之间也存在相互促进作用,缺乏或过量都能彼此影响。矿物质与维生素之间的关系也十分密切,如维生素C有利于铁的吸收，维生素D调节钙、磷代谢等等。
硒和维生素E互相配合可抑制脂质过氧化物的产生。蛋白质对微旦元素在体内的运输有很大作用,例如，铜的运输靠铜蓝蛋自，铁的运输靠运铁蛋白。锌参与蛋白质合成，锌缺乏影响儿童生长发育。碘是甲状腺素的组成成分,而甲状腺素是调节人体能量代谢的重要激素,对蛋白质、脂肪和碳水化合物的代谢有促进作用。
